Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRNQ16849 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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