Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDUFA9Q16795 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms