Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA3Q16787 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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