Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBRQ14739 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBRQ14739 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LBRQ14739 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBRQ14739 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LBRQ14739 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LBRQ14739 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LBRQ14739 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LBRQ14739 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LBRQ14739 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LBRQ14739 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBRQ14739 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBRQ14739 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBRQ14739 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBRQ14739 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBRQ14739 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBRQ14739 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBRQ14739 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBRQ14739 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBRQ14739 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBRQ14739 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LBRQ14739 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBRQ14739 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBRQ14739 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBRQ14739 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms