Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCARF1Q14162 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARF1Q14162 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
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