Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM53BQ14153 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms