Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP1Q13829 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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TNFAIP1Q13829 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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