Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC1Q13547 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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