Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
C1orf61Q13536 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf61Q13536 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf61Q13536 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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