Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
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