Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATMQ13315 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATMQ13315 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATMQ13315 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATMQ13315 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATMQ13315 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATMQ13315 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATMQ13315 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATMQ13315 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATMQ13315 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATMQ13315 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATMQ13315 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATMQ13315 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATMQ13315 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
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