Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPQ12770 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms