Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 SLO1YER180C-A 258 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YGR073CYGR073C 372 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YJR128WYJR128W 360 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 ATP18YML081C-A 180 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 PLB2YMR006C 2121 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YPR123CYPR123C 435 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 snR54snR54 86 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 PLM2YDR501W 1566 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 GCD2YGR083C 1956 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 CDC5YMR001C 2118 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 MDL1YLR188W 2088 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 AAD16YFL057C 459 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 PAU15YIR041W 375 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 COQ5YML110C 924 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YMR315WYMR315W 1050 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YNL235CYNL235C 432 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 GIP1YBR045C 1920 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RFT1YBL020W 1725 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 BRE2YLR015W 1518 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 SCT1YBL011W 2280 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 NEL1YHR035W 1893 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 SSL1YLR005W 1386 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RXT3YDL076C 885 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YDL152WYDL152W 366 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 SDL1YIL167W 633 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 BNA1YJR025C 534 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 MCR1YKL150W 909 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RNH203YLR154C 333 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 APS1YLR170C 471 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 GLO1YML004C 981 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YNL089CYNL089C 477 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 MKK2YPL140C 1521 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 GAT2YMR136W 1683 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 MUD2YKL074C 1584 nt5.46□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 ARB1YER036C 1833 nt5.46□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RPL12AYEL054C 498 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YER034WYER034W 558 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RAD51YER095W 1203 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YER175W-AYER175W-A 165 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RTS3YGR161C 792 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 EPS1YIL005W 2106 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 TAD2YJL035C 753 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 CGI121YML036W 546 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 MRPL10YNL284C 969 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 GRX7YBR014C 612 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RMI1YPL024W 726 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 ECM33YBR078W 1290 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 CTP1YBR291C 900 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 MSL5YLR116W 1431 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 GPB1YOR371C 2694 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 PGS1YCL004W 1566 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 MEF1YLR069C 2286 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 GPA2YER020W 1350 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SLY41YOR307C 1362 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 CDC4YFL009W 2340 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SIS2YKR072C 1689 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 snR65snR65 100 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YGR228WYGR228W 345 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YHL037CYHL037C 402 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YKL066WYKL066W 444 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YKL151CYKL151C 1014 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YPR050CYPR050C 414 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 PDB1YBR221C 1101 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 NAM9YNL137C 1461 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 ERG5YMR015C 1617 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RKM3YBR030W 1659 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 VNX1YNL321W 2727 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 PGK1YCR012W 1251 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YCR013CYCR013C 648 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 PER1YCR044C 1074 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YCR101CYCR101C 549 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 FMN1YDR236C 657 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 NCB2YDR397C 441 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 DOT1YDR440W 1749 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 AGX1YFL030W 1158 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YKL077WYKL077W 1179 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YML122CYML122C 381 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 ASI2YNL159C 870 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YAP1801YHR161C 1914 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 TNA1YGR260W 1605 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 NGL3YML118W 1518 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YLL067CYLL067C 3618 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 TSR1YDL060W 2367 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 FAL1YDR021W 1200 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YGL081WYGL081W 963 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SOL4YGR248W 768 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SPC1YJR010C-A 285 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 MRP17YKL003C 396 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 RPS19AYOL121C 435 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 GSY2YLR258W 2118 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 MDH3YDL078C 1032 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 GCN4YEL009C 846 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-DR3Q12441 SOH1YGL127C 384 nt5.42□□□□□ -1.54
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