Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 RIA1YNL163C 3333 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 CET1YPL228W 1650 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 THI13YDL244W 1023 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 OST5YGL226C-A 261 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 GCD14YJL125C 1152 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 THI11YJR156C 1023 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 MET14YKL001C 609 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 SFH1YLR321C 1281 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 OPY1YBR129C 987 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 BI3Q0115 1554 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 ABF1YKL112W 2196 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 RIM21YNL294C 1602 nt4.17□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 UPC2YDR213W 2742 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 UBC9YDL064W 474 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 YGL138CYGL138C 1038 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 YGL152CYGL152C 678 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 BAT2YJR148W 1131 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 EOS1YNL080C 1101 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 MCK1YNL307C 1128 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 LOA1YPR139C 903 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 MET17YLR303W 1335 nt4.16□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 HOYDL227C 1761 nt4.15□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 SLI1YGR212W 1407 nt4.15□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 HUL4YJR036C 2679 nt4.15□□□□□ -1.74
LCB4Q12246 TIF4632YGL049C 2745 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YCR007CYCR007C 720 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 RPL24AYGL031C 468 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YGR269WYGR269W 327 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 FUR1YHR128W 651 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SVP26YHR181W 687 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YNL035CYNL035C 1170 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 MRPL17YNL252C 846 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 MRPL27YBR282W 441 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SEC2YNL272C 2280 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 TDA11YHR159W 1515 nt4.15□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 APP1YNL094W 1764 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 RPS11AYDR025W 471 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 LSM4YER112W 564 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 IGO2YHR132W-A 396 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 CAB2YIL083C 1098 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 AIM19YIL087C 474 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 UTP11YKL099C 753 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YMR085WYMR085W 1299 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 RPS19AYOL121C 435 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 RET3YPL010W 570 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SKM1YOL113W 1968 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 RPG1YBR079C 2895 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 PLM2YDR501W 1566 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SHE9YDR393W 1371 nt4.14□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 MSE1YOL033W 1611 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 TOG1YER184C 2385 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YOL153CYOL153C 1746 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 CEX1YOR112W 2286 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 IKS1YJL057C 2004 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 NHP10YDL002C 612 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 RUB1YDR139C 234 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 HTB1YDR224C 396 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YDR274CYDR274C 372 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YGR016WYGR016W 573 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 CDC12YHR107C 1224 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 FMP33YJL161W 543 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 MMM1YLL006W 1281 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 VMA6YLR447C 1038 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 TOM7YNL070W 183 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 CBP3YPL215W 1008 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 XKS1YGR194C 1803 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 PEX30YLR324W 1572 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 ALE1YOR175C 1860 nt4.13□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 ERT1YBR239C 1590 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 PDS1YDR113C 1122 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 CNN1YFR046C 1086 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 AIM18YHR198C 966 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 AHP1YLR109W 531 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 MDM12YOL009C 816 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 USV1YPL230W 1176 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 PBN1YCL052C 1251 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YRB30YGL164C 1323 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SST2YLR452C 2097 nt4.12□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 SKG6YHR149C 2205 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 KIN4YOR233W 2403 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YDR131CYDR131C 1671 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YGL176CYGL176C 1665 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 ELO2YCR034W 1044 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 NBP2YDR162C 711 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 ATP6Q0085 780 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 YGL242CYGL242C 546 nt4.11□□□□□ -1.75
LCB4Q12246 TDA10YGR205W 873 nt4.11□□□□□ -1.75
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