Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 FMP33YJL161W 543 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 RPB8YOR224C 441 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 AYR1YIL124W 894 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 MSB1YOR188W 3414 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 CDC6YJL194W 1542 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 YLR352WYLR352W 2424 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 SWP1YMR149W 861 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 MCA1YOR197W 1299 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 DIM1YPL266W 957 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 RIM4YHL024W 2142 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-BRQ12193 SNU23YDL098C 585 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 SEN1YLR430W 6696 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 FLO9YAL063C 3969 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 BOI1YBL085W 2943 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 AXL1YPR122W 3627 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 YMR187CYMR187C 1296 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 YHR080CYHR080C 4038 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 IZH2YOL002C 954 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 SGS1YMR190C 4344 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 INP53YOR109W 3324 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 INP52YNL106C 3552 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 CCT7YJL111W 1653 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 SPA2YLL021W 4401 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 MSH2YOL090W 2895 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 PHO91YNR013C 2685 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 MAL12YGR292W 1755 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 MDM30YLR368W 1797 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 HUL4YJR036C 2679 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 ATP7YKL016C 525 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 DDP1YOR163W 567 nt3.92□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 RRP1YDR087C 837 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 RPS24AYER074W 408 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 YOR277CYOR277C 309 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 MDM38YOL027C 1722 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 CAF130YGR134W 3369 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 EBS1YDR206W 2655 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 HER1YOR227W 3741 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 DAD4YDR320C-A 219 nt3.91□□□□□ -1.78
TY1B-BRQ12193 YDR491CYDR491C 492 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 PPA2YMR267W 933 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 NCS2YNL119W 1482 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 KAP123YER110C 3342 nt3.9□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 HOF1YMR032W 2010 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 VAC17YCL063W 1272 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 RAD55YDR076W 1221 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 GPI19YDR437W 423 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 YGR269WYGR269W 327 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 TCO89YPL180W 2400 nt3.89□□□□□ -1.79
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TY1B-BRQ12193 DSD1YGL196W 1287 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 ATP12YJL180C 978 nt3.89□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 YDL109CYDL109C 1944 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 FKS3YMR306W 5358 nt3.88□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 PSY2YNL201C 2577 nt3.88□□□□□ -1.79
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TY1B-BRQ12193 DNF1YER166W 4716 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 RPO41YFL036W 4056 nt3.87□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 MCM4YPR019W 2802 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 TMN3YER113C 2121 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 FPR1YNL135C 345 nt3.86□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 EDS1YBR033W 2760 nt3.85□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 YIP5YGL161C 933 nt3.85□□□□□ -1.79
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TY1B-BRQ12193 ATG13YPR185W 2217 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 GRS2YPR081C 1857 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 SPT4YGR063C 309 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 YPL107WYPL107W 747 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 SUL1YBR294W 2580 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 RPA190YOR341W 4995 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 CCH1YGR217W 6120 nt3.84□□□□□ -1.79
TY1B-BRQ12193 NAT5YOR253W 531 nt3.84□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 FLO10YKR102W 3510 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 ERG11YHR007C 1593 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 BRR2YER172C 6492 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 YJR037WYJR037W 384 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 OCA1YNL099C 717 nt3.83□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 FPK1YNR047W 2682 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 YPT35YHR105W 645 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 URA2YJL130C 6645 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 ALG2YGL065C 1512 nt3.82□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 KIN28YDL108W 921 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 YDR274CYDR274C 372 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 YGL082WYGL082W 1146 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 SAP190YKR028W 3102 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 ATG21YPL100W 1491 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 ULP1YPL020C 1866 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 RRG7YOR305W 729 nt3.81□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 PWP2YCR057C 2772 nt3.8□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 CNA1YLR433C 1662 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 RPL24BYGR148C 468 nt3.79□□□□□ -1.8
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TY1B-BRQ12193 DOM34YNL001W 1161 nt3.79□□□□□ -1.8
TY1B-BRQ12193 ARO1YDR127W 4767 nt3.79□□□□□ -1.8
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