Protein–RNA interactions for Protein: Q11201

ST3GAL1, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1Q11201 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ST3GAL1Q11201 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ST3GAL1Q11201 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms