Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPSF1Q10570 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
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