Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms