Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms