Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP4Q02446 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SP4Q02446 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP4Q02446 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP4Q02446 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP4Q02446 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP4Q02446 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP4Q02446 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP4Q02446 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP4Q02446 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP4Q02446 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP4Q02446 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP4Q02446 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP4Q02446 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP4Q02446 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms