Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms