Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD83Q01151 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD83Q01151 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD83Q01151 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD83Q01151 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD83Q01151 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD83Q01151 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD83Q01151 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD83Q01151 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD83Q01151 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD83Q01151 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD83Q01151 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms