Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms