Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDK5Q00535 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms