Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC5P78333 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC5P78333 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC5P78333 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC5P78333 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC5P78333 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms