Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP2P78314 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP2P78314 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP2P78314 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP2P78314 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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