Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVFC1P60507 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms