Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXCT1P55809 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms