Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH8P55286 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH8P55286 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH8P55286 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH8P55286 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH8P55286 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH8P55286 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH8P55286 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH8P55286 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH8P55286 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH8P55286 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms