Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP1P54849 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP1P54849 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EMP1P54849 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EMP1P54849 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms