Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB1P54762 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms