Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23AP54725 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms