Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP3P54108 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms