Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THOP1P52888 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THOP1P52888 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THOP1P52888 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
THOP1P52888 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
THOP1P52888 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
THOP1P52888 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THOP1P52888 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THOP1P52888 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THOP1P52888 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THOP1P52888 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms