Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGDP52209 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGDP52209 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGDP52209 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGDP52209 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGDP52209 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGDP52209 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGDP52209 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGDP52209 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGDP52209 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGDP52209 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGDP52209 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGDP52209 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGDP52209 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGDP52209 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms