Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1GP51170 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms