Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPFP49454 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPFP49454 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPFP49454 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPFP49454 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPFP49454 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPFP49454 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPFP49454 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPFP49454 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPFP49454 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms