Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLMP48507 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCLMP48507 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLMP48507 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLMP48507 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLMP48507 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLMP48507 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLMP48507 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCLMP48507 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCLMP48507 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCLMP48507 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLMP48507 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLMP48507 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLMP48507 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLMP48507 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLMP48507 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLMP48507 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLMP48507 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms