Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRB2P47870 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms