Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP13P45452 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP13P45452 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP13P45452 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP13P45452 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP13P45452 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP13P45452 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP13P45452 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP13P45452 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP13P45452 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP13P45452 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP13P45452 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP13P45452 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP13P45452 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP13P45452 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP13P45452 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP13P45452 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms