Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRATP43155 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRATP43155 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CRATP43155 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRATP43155 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRATP43155 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRATP43155 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRATP43155 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRATP43155 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRATP43155 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRATP43155 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRATP43155 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRATP43155 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRATP43155 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRATP43155 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms