Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTTP42858 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTTP42858 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTTP42858 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTTP42858 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTTP42858 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTTP42858 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTTP42858 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTTP42858 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTTP42858 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTTP42858 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTTP42858 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTTP42858 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTTP42858 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTTP42858 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTTP42858 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTTP42858 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTTP42858 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTTP42858 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTTP42858 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTTP42858 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTTP42858 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTTP42858 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTTP42858 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTTP42858 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTTP42858 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTTP42858 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTTP42858 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTTP42858 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTTP42858 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTTP42858 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTTP42858 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTTP42858 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTTP42858 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTTP42858 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms