Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMPOP42166 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMPOP42166 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMPOP42166 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMPOP42166 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMPOP42166 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMPOP42166 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMPOP42166 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMPOP42166 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMPOP42166 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMPOP42166 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMPOP42166 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMPOP42166 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMPOP42166 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMPOP42166 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMPOP42166 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMPOP42166 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMPOP42166 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMPOP42166 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMPOP42166 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms