Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP8P40818 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP8P40818 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP8P40818 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP8P40818 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP8P40818 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP8P40818 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP8P40818 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP8P40818 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP8P40818 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP8P40818 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP8P40818 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP8P40818 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP8P40818 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP8P40818 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP8P40818 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms