Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 GCD7YLR291C 1146 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 CPR3YML078W 549 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 ERD2YBL040C 660 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 INN1YNL152W 1230 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 YBL077WYBL077W 432 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 YNL320WYNL320W 855 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 AIM41YOR215C 558 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 AUS1YOR011W 4185 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 RRP5YMR229C 5190 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 PMT6YGR199W 2280 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 RSF2YJR127C 4143 nt3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 SYT1YPR095C 3681 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 TGL1YKL140W 1647 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 PUG1YER185W 912 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 YFL065CYFL065C 309 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 ILV5YLR355C 1188 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 YET2YMR040W 483 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 PRP22YER013W 3438 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 AIM14YGL160W 1713 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 MTH1YDR277C 1302 nt3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 MDM38YOL027C 1722 nt3.59□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 PSF1YDR013W 627 nt3.59□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.59□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 TTI2YJR136C 1266 nt3.59□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 REH1YLR387C 1299 nt3.59□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 GOT1YMR292W 417 nt3.59□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 CNS1YBR155W 1158 nt3.59□□□□□ -1.83
SHQ1P40486 PRP3YDR473C 1410 nt3.59□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 UTP25YIL091C 2166 nt3.59□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YCR101CYCR101C 549 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 LSM6YDR378C 261 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 CLC1YGR167W 702 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SPC3YLR066W 555 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YOR186WYOR186W 435 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 RRP36YOR287C 903 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 IMH1YLR309C 2736 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YHL012WYHL012W 1482 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SHQ1YIL104C 1524 nt3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 ERG26YGL001C 1050 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YTA7YGR270W 4140 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YOL050CYOL050C 321 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 VPS21YOR089C 633 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SHE3YBR130C 1278 nt3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YLR177WYLR177W 1887 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 PGS1YCL004W 1566 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 RRN7YJL025W 1545 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 ARP4YJL081C 1470 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SAS4YDR181C 1446 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SER3YER081W 1410 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SUP45YBR143C 1314 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 ARD1YHR013C 717 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YPL088WYPL088W 1029 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YDL176WYDL176W 2127 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YMR1YJR110W 2067 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 MSR1YHR091C 1932 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 EXO5YBR163W 1758 nt3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 UBP12YJL197W 3765 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 RNT1YMR239C 1416 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SRO9YCL037C 1305 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YIL086CYIL086C 309 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 RPL19BYBL027W 570 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SSO2YMR183C 888 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 PSF3YOL146W 585 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 DIB1YPR082C 432 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SIZ1YDR409W 2715 nt3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 REC8YPR007C 2043 nt3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YJR030CYJR030C 2238 nt3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YBR238CYBR238C 2196 nt3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YCL068CYCL068C 783 nt3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 COS8YHL048W 1146 nt3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 YKL177WYKL177W 339 nt3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 SLM2YNL047C 1971 nt3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 ZDS2YML109W 2829 nt3.53□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 snR57snR57 88 nt3.53□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 TMC1YOR052C 453 nt3.53□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 TFB2YPL122C 1542 nt3.53□□□□□ -1.84
SHQ1P40486 STE6YKL209C 3873 nt3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 ALG1YBR110W 1350 nt3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YDR193WYDR193W 399 nt3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 MIG3YER028C 1185 nt3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 PRS5YOL061W 1491 nt3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 PEX1YKL197C 3132 nt3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 PWP2YCR057C 2772 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 CAF130YGR134W 3369 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 OPI6YDL096C 327 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 ERJ5YFR041C 888 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YGR126WYGR126W 693 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 SFH5YJL145W 885 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 AIM39YOL053W 1188 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 GAT2YMR136W 1683 nt3.51□□□□□ -1.85
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