Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHI3L1P36222 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms