Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX2P32243 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX2P32243 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX2P32243 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX2P32243 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX2P32243 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX2P32243 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX2P32243 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX2P32243 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX2P32243 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX2P32243 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX2P32243 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX2P32243 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX2P32243 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX2P32243 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX2P32243 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX2P32243 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX2P32243 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX2P32243 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX2P32243 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX2P32243 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX2P32243 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX2P32243 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX2P32243 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX2P32243 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX2P32243 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX2P32243 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms