Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MIPP30301 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MIPP30301 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MIPP30301 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MIPP30301 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIPP30301 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIPP30301 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIPP30301 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIPP30301 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIPP30301 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIPP30301 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIPP30301 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIPP30301 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIPP30301 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms