Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC27P30260 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC27P30260 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC27P30260 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC27P30260 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC27P30260 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC27P30260 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC27P30260 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC27P30260 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC27P30260 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC27P30260 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC27P30260 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC27P30260 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC27P30260 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC27P30260 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC27P30260 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC27P30260 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms