Protein–RNA interactions for Protein: P27482

CALML3, Calmodulin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML3P27482 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALML3P27482 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALML3P27482 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALML3P27482 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALML3P27482 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALML3P27482 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALML3P27482 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALML3P27482 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALML3P27482 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALML3P27482 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALML3P27482 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML3P27482 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML3P27482 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML3P27482 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML3P27482 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALML3P27482 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CALML3P27482 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms